NSCLC中TRAF家族蛋白的表达和预后以及功能综合分析

背景与目的 肺癌是目前世界上发病率和死亡率较高的恶性肿瘤之一。然而,肺癌进展的确切机制仍不清楚。肿瘤坏死因子受体相关因子(tumor necrosis factor receptor associated factor, TF)家族成员是胞质接头蛋白,既行使接Oral immunotherapy头蛋白的功能又具有泛素连接酶活性,可调控多种受体信号途径,进而激活核因子κB(nuclear factor kappa-B,NF-κB)、有丝分裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase, MAPK)和干扰素调节因子(interferon regulatory factor, IR F)信号。本研究旨在探讨TR AFs在不同组织和癌症类型中的表达以及在非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer, NSCLC)中的mRNA表达、蛋白表达、预后意义及功能富集分析,为NSCLC的诊断和治疗提供新策略。方法 利用基因型组织表达数据库的RIACS-010759配制NA测序数据集分析TRAF家族成员在不同人体组织中的表达水平;利用癌细胞百科全书数据库中的RNA测序数据集分析TRAF家族成员在不同类型癌症细胞系中的表达水平;利用癌症基因组图谱(The Cancer Genome A购买AZD1152-HQPAtlas, TCGA)数据库的RNA测序数据集分析人类不同类型癌症中TF家族成员的mRNA表达水平;利用人类蛋白质图谱数据库中的免疫组化数据分析NSCLC包括肺腺癌和肺鳞癌中的TRAF家族成员的蛋白表达水平;利用Kaplan-Meier Plotter中的NSCLC患者的生存数据集,通过对数秩检验评估TRAF家族成员的表达与预后生存的相关性;利用TCGA数据库中NSCLC患者的RNA测序数据集对TF家族成员相关基因进行基因本体论功能注释分析和京都基因与基因组百科全书通路富集分析;利用基于TCGA数据库的RNA测序数据集,通过ESTIMATE对TRAF家族成员的表达水平与肿瘤免疫微环境进行相关性分析。结果 TF家族成员呈现显著的组织表达特异性,TF2、TF3、TF6和TF7广泛表达于多种组织,而TF1、TF4和TF5则在个别组织中表达受限;TF家族成员的表达在不同类型癌症细胞系中具有高度特异性;在肺腺癌和肺鳞癌组织的mRNA数据中,TRAF2、TRAF4、TRAF5和TRAF7的表达均上调,TRAF6的表达均下调,TRAF1仅在肺腺癌中上调,而TRAF3仅在肺…