15种中药基原豆科植物查尔酮合酶基因的生物信息学分析

Supplies & Consumables查尔酮合酶(chalcone synthase, CHS)是植物类黄酮生物合成途径的关键限速酶之一。为了比较不同豆科植物CHS的氨基酸序列结构特征及预测其在调控类黄酮化合物的生物合成过程中发挥的作用,本研究利用生物信息学分析15种中药基原的豆科植物CHS基因的编码蛋白的理化性质、亚细胞定位、蛋白二级结构与系统发育Adezmapimod树。结果表明,15种CHS蛋白均呈酸性,属于亲水性蛋白,大部分为稳定蛋白,定位于细胞质,无跨膜结构与信号肽,磷酸化位点总数51~62个;α螺旋与无规则卷曲是豆科植物CHS蛋白中主要存在的结构原件;15个豆科CHS基因均有CHS_like的保守序列,其中5个属于PLN03172基因家族,其他的属于PLN03173基因家族;CHS的氨基酸序列高度同源,同源度为79.42%,均具有3个保守的蛋白催化位点、2个高度保守结构域、2个底物特异性残基与1个丙二酰辅酶A结合部位;系统进化树结果显示15种豆科植物CHS被分为3个分支,与植物分类学基本一致。基于上述结果,15种中药基原的豆科CHS具有较高的保守性和稳定性,推测可能执行类似的功能,研究结果为豆科植物CHS的功能及作用机selleck HPLC制研究提供了理论依据。