背景:重症肺炎是临床上常见的急危重症,抗感染是其治疗的核心,这就需要早期全面、快速的识别感染病原体。目前临床获得病原学结果的检测方法包括传统病原学检测方法及宏基因二代测序技术(metagenomics Next Generation Sequencing,m NGS)技术。我们总结了吉林大学第二医院应用两种病原学方法检测出的重症肺炎感染病原体情况,有利于指导重症肺炎患者早期经验性抗感染方案的选择。目的:明确重症肺炎患者病原体分布特点及合并不同基础疾病的重症肺炎患者感染病原体特点,同时探讨m NGS在重症肺炎病原体检测中的应用价值。方法:收集2019年9月至2022年10月吉林大学第二医院收治的诊断为重症肺炎且送检痰或支气管肺泡灌洗液(Bronchoalveolar Lavage Fluid,BALF)或血m NGS检测及传统病原学检测(一般细菌/真菌培养、抗酸杆菌涂片、G试验/GM试验、呼吸道病毒Ig M抗体及支原体、衣原体及军团菌Ig M抗体)的100例患者的临床资料及病原学结果进行统计分析。根据基础疾病将重症肺炎患者划分为不同亚组,明确不同亚组病原体特点。结果:1.100例重症肺炎患者通过m NGS技术联合传统病原学检测方法检出细菌24种/131株(包括结核分枝杆菌5株),常见的为铜绿假单胞菌、鲍曼不动杆菌、嗜麦芽寡养单胞菌、肠球菌、肺炎链球菌、金黄色葡萄球菌;病毒5种/50株,常见的为巨细胞病毒、单纯疱疹病毒;真菌7种/36株,常见的为肺孢子菌、曲霉菌、白色念珠菌。2.mNGS技术检出病原体33种/203株,常见的细菌为铜绿假单胞菌、鲍曼不动杆菌、嗜麦芽寡养单胞菌、肺炎克雷伯杆菌、屎肠球菌、肺炎链球菌、金黄色葡Medical care萄球菌;常见的真菌为肺孢子菌、曲霉菌、白色念珠菌;常见的病毒为巨细胞病毒、单纯疱疹病毒。Others抑制剂3.传统病原学方法检出病原体19种/75株,常见的细菌为鲍曼不动杆菌、嗜麦芽寡养单胞菌、铜绿假单胞菌、肺炎克雷伯杆菌、金黄色葡萄球菌;常见的真菌为白色念珠菌。4.各基础疾病亚组病原学检测情况:(1)自身免疫性疾病合并重症肺炎常见病原体为巨细胞病毒、单纯疱疹病毒、肺孢子菌,以上病原体均由m NGS检出。(2)恶性肿瘤放化疗合并重症肺炎常见病原体为巨细胞病毒、肺孢子菌、曲霉菌、单纯疱疹病毒,8株巨细胞病毒中(m NGS均检测到)仅1株同时被传统病原学方法检测到;肺孢子菌和单纯疱疹病毒均由m NGS检测到;4株曲霉菌中(m NGS均检测到)仅1株同时被传统病原学方法检测到。(3)脑血管疾病合并重症肺炎常见病原体为嗜麦芽寡养单胞菌、铜绿假单胞菌、单纯疱疹病毒、金黄色葡萄球菌、肺炎克雷伯杆菌、巨细胞病毒,m NGS及传统病原学方法对嗜麦芽寡养单胞菌、铜绿假单胞菌、肺炎克雷伯杆菌检出具有一致性(Kappa=0.46、0.47、0.60);4株金黄色葡萄球菌中(m NGS均检测到)仅1株同时被传统病原学方法检测到;单纯疱疹病毒及巨细胞病毒均通过m NGS检测到。(4)慢性气道疾病合并重症肺炎常见病原体为铜绿假单胞菌、鲍曼不动杆菌、肠球菌、肺炎克雷伯杆菌等,m NGS及传统病原学方法对铜绿假单胞菌、鲍曼不动杆菌、肺炎克雷伯杆菌的检出具有一致性(Kappa=0.48、0.67、0.45);肠球菌均通过m NGS检出。结论:1.重症肺炎患者检出率较高的Ipatasertib分子式病原体为细菌,常见的包括铜绿假单胞菌、鲍曼不动杆菌、嗜麦芽寡养单胞菌、肺炎克雷伯杆菌;病毒、真菌检出率亦较高。2.自身免疫性疾病合并重症肺炎常见病原体为巨细胞病毒、单纯疱疹病毒、肺孢子菌;恶性肿瘤放化疗合并重症肺炎常见病原体为巨细胞病毒、肺孢子菌、曲霉菌、单纯疱疹病毒;脑血管疾病合并重症肺炎常见病原体为嗜麦芽寡养单胞菌、铜绿假单胞菌、单纯疱疹病毒;慢性气道疾病合并重症肺炎常见病原体为铜绿假单胞菌、鲍曼不动杆菌、肠球菌、肺炎克雷伯杆菌。3.mNGS在巨细胞病毒、单纯疱疹病毒、肺孢子菌、曲霉菌、结核分枝杆菌检测中具有优势,建议重症肺炎患者早期送检m NGS以确认感染病原体。